برخی گلایه‌های رییس نمایندگی نهاد مقام معظم رهبری در دانشگاه‌ها و اختلاف‌نظرهایی که گفته می‌شد در وزارت علوم وجود داشت پس از مدتی به انتشار شایعه استعفای حجت‌الاسلام‌والمسلمین محمدیان از نهاد منجر شد؛ گرچه محمدیان چنین اختلافاتی را تکذیب کرد اما شایعه درخواست کناره‌گیری بعد از مدتی در رسانه‌های رسمی نیز اعلام شد. این کناره‌گیری اما از سوی رهبر معظم انقلاب پذیرفته نشده است.
حجت‌الاسلام‌والمسلمین محمدیان پس از انتشار اخبار استعفای وی سپس ابقا به عنوان رییس نمایندگی نهاد رهبری در دانشگاه‌ها توسط مقام معظم رهبری با بیان اینکه فعالیت خود را در نهاد رهبری دانشگاه‌ها ادامه خواهم داد، گفت: رهبر معظم انقلاب فرمودند؛ «الان به هیچ وجه مصحلت نیست لذا شما به کار خودتان ادامه دهید.» بنابراین وقتی دستور این است که «ادامه دهید» ما هم به عنوان یک سرباز تا وقتی که نظر ایشان هست، ادامه می‌دهیم.
براساس اعلام پایگاه اطلاع‌رسانی نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه‌ها(مأوا)، حجت‌الاسلام‌والمسلمین محمدیان در جمع مسوولان دفاتر استانی نهاد رهبری در دانشگاه‌های کشور با اشاره به ادامه فعالیت خود به عنوان رییس نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه‌ها اظهار کرد: به دنبال نیروی تازه نفس برای ادامه فعالیت در نهاد بودم که رهبر معظم انقلاب پس از بررسی فرمودند:«الان به هیچ‌وجه مصحلت نیست لذا شما به کار خودتان ادامه دهید.»
او تاکید کرد: من وظیفه داشتم که نظر کارشناسی خودم را بیان کنم اما وقتی دستور این است که «ادامه دهید»؛ ما هم به عنوان یک سرباز -تا وقتی که نظر ایشان هست- ادامه می‌دهیم.
حجت‌الاسلام محمدیان با تاکید بر اینکه طبق اساسنامه نهاد نمایندگی رهبری در دانشگاه‌ها، دوره ریاست نهاد 3ساله است، افزود: در اینجا لازم است توضیحی درباره ادامه کارم در نهاد عرض کنم. البته من استعفا نداده بودم؛ اما به هر حال این طور مطرح شد که استعفا داده‌ام. اگر دوستان اساسنامه نهاد را ملاحظه کنند، می‌بینند که دوره ریاست نهاد 3سال است البته ممکن است این دوره دو سه بار تجدید شود اما بالاخره این تجدید هم یک عرفی دارد.
به گفته او، حجت‌الاسلام قمی 8 سال ریاست نهاد را بر عهده داشت ولی درحال حاضر مسوولیت وی به 12سال رسیده است. لذا بحث استعفا مطرح نیست؛ بحث این است که دوره این مسوولیت خیلی وقت است که تمام شده است؛ بنابراین اعتقاد شخصی‌ام این است که 8 سال برای این مسوولیت‌ها کافی است و بیشتر از این نباید این پست‌ها را نگه داشت بلکه باید تحویل افراد تازه‌نفسی داد که بتوانند این مسیر را بهتر و کامل‌تر ادامه دهند که این جابه‌جایی‌ها هم غیرطبیعی نیست بلکه اتفاقا ماندن در این مسوولیت‌ها یک مقدار جای سوال دارد که «یک فرد چقدر می‌خواهد در یک مسوولیت بماند درحالی که در این مجموعه، افراد بسیار شایسته‌یی وجود دارند که خیلی بهتر می‌توانند کار را ادامه دهند».
پایان دوره نه استعفا
مسوول نمایندگی نهاد رهبری در دانشگاه‌ها تاکید کرد: امسال این مطلب را به صورت مکتوب خدمت حضرت آقا نوشتم و در این نامه عرض کردم «دوره ما خیلی وقت است که تمام شده و نهاد هم نیروهای خوبی دارد که می‌توانند این مسوولیت را انجام دهند لذا اجازه بدهید این فضا تغییر کند و فضای جدیدی در مجموعه نهاد ایجاد شود و روح تازه‌یی در نهاد دمیده شود.» بنابراین «استعفا» کلمه مناسبی نبود که به کار برده شد چون معمولا در استعفا یک نوع قهر یا خستگی وجود دارد ولی ما از هیچ‌کسی قهر نکرده‌ایم و اصلا با وجود دوستانی به این خوبی، جای قهر هم وجود ندارد. الحمدالله بحث خستگی هم مطرح نیست و الان هم احساس خستگی ندارم.
استعفا به دلیل بودجه برداشت دقیقی نبود
او ادامه داد: اینکه بنده به خاطر بودجه استعفا داده‌ام» نیز برداشت دقیقی نبود چون مشکلات بودجه‌یی ما مربوط به امسال نیست؛ بلکه چند سال است که ما از نظر بودجه مشکل پیدا کرده‌ایم. البته نه اینکه ما به لحاظ مالی تحت فشار نیستیم اما واقعا بحث من به این فشارها ارتباطی نداشت. هر چند من احتمال می‌دادم که اگر تغییر و تحولی شود از این جهت هم گشایشی برای نهاد اتفاق بیفتد؛ ولی این جزو عوامل اصلی محسوب نمی‌شد.
حجت‌الاسلام محمدیان افزود: من در آن نامه از رهبر معظم انقلاب خواهش کردم که «این بار با ملاحظه بیشتری به این مساله عنایت بفرمایید» لذا ایشان هم دستور دادند که این موضوع در دفتر بررسی شود حالا اینکه نتیجه بررسی دفتر ایشان چه بوده، من کاملا در جریان نیستم اما نهایتش این شد که فرمودند:«الان به هیچ‌وجه مصلحت نیست لذا شما به کار خودتان ادامه دهید.»
او اظهار کرد: من وظیفه داشتم که خودم را عرضه کنم و نظر کارشناسی خود را بیان کنم اما وقتی دستور این است که «ادامه دهید» ما هم به عنوان یک سرباز -تا وقتی که نظر ایشان هست- ادامه می‌دهیم. ما برای خودمان نسبت به ایشان «مقام حرفی» قائل هستیم، نه مقام اسمی یا فعلی! فرق حرف با اسم و فعل این است که خودش هیچ معنایی ندارد، مگر اینکه در کنار یک اسم یا فعل قرار بگیرد. ما ایشان را نایب امام زمان(ع) می‌دانیم و اطاعت از ایشان را هم اطاعت از امام زمان(ع) می‌دانیم. ان‌شاءالله که بتوانیم در این دوره جدید آن طوری که خواست ایشان هست و رهنمودهای ایشان در اختیار ما قرار داده، عمل کنیم.
