تصمیم‌گیری درباره روابط دوجانبه پس از همه‌پرسی برعهده شورای عالی امنیت ملی است.رییس کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس با اشاره به اقدامات غیرعلنی ایران در قبال همه‌پرسی اقلیم کردستان تاکید کرد که تصمیم مسعود بارزانی به نفع اقلیم کردستان و تمامیت ارضی عراق نیست و با اشاره به لزوم اتخاذ تصمیمات قاطع‌تر از سوی دولت عراق گفت که تصمیم‌گیری درباره روابط ایران و اقلیم کردستان پس از انجام همه‌پرسی برعهده شورای عالی امنیت ملی است. به گزارش ایلنا، علاءالدین بروجردی در واکنش به انتقاد برخی تحلیلگران مبنی بر اتخاذ مواضع انفعالی و دیرهنگام از سوی جمهوری اسلامی ایران در رابطه با برگزاری این همه‌پرسی در اقلیم کردستان اعلام کرد: بسیاری از اقدامات جمهوری اسلامی در ماه‌های قبل غیرعلنی بود. در واقع جمهوری اسلامی ایران اقدامات لازم را انجام داده اما لزوما علنی نشده بود. وی همچنین در واکنش به تصمیم رهبران اقلیم کردستان در خصوص برگزاری همه‌پرسی استقلال یادآور شد: واقعیت این است که کاری که مسعود بارزانی به‌دنبال انجام آن است، لزوما به نفع کردستان و تمامیت ارضی عراق نخواهد بود. وی خاطرنشان کرد: فرض بر این است که عراق به عنوان کشور همسایه ما تصمیماتی قاطع‌تر در ارتباط با تجزیه کشور خود اتخاذ کند.
